保持板片的清洁是保持高传热系数的重要条件之一。在板片间，介质是沿着狭窄曲折的流道运动的，即使产生不太厚的垢层，也将引起流道的变化，显著地影响流体的运动，使压降增大，传热系数下降，例如某糖厂在采暖中使用板式换热器，由于二次水没有很好的处理，使用过程中仅两个月就将流道堵塞，不能继续运行。这种方法是将一种化学溶液循环地通过换热器，使板片表面的污垢溶解、排出。
此法不需要拆开板式换热器，简化了清洗过程，也减轻了清洗的劳动程度。由于板片波纹能促进清洗液剧烈湍流，有利于垢层溶解，所以化学清洗法是比较理想的方法。这种方法是将板片后用刷子进行人工洗刷，从而达到清除板片表面污垢的目的。此法虽然比较直接，但对较坚硬、较厚的垢层。不易清洗干净。对于污垢层比较坚硬又较厚的情况，单纯采用上述一种方法都难以清洗干净。综合法是先用化学清洗法软化垢层，再用机械（物理）清洗法除去垢层，以保持板片清洁干净。
